Marco Amarita fue acusado en 1704 de bigamia por el Tribunal de la Santa Inquisición. Se le acusaba de haber contraído segundas nupcias en el pueblo de Santa Cruz de Mudela. Él estaba casado en primeras nupcias con Leonor de Alarcón, quien residía en Madrid. El hermano de Leonor de Alarcón, Fernando de Alarcón, se enteró de que Juan Roldán, vecino de Cuenca y criado de Joseph de Sancha y Ayala, tenía una prima hermana en Santa Cruz de Mudela a la que le puede preguntar si ha visto en esa a Marco Amarita, pues todas las sospechas conducen hacía ese lugar. Por este motivo, Juan Roldán escribió una carta al marido de su prima, Juan de Saavedra, preguntándole por Marco Amarita. La respuesta a esta misiva fue la que se adjuntó al proceso. En ella Juan de Saavedra afirmaba que Marco Amarita se había cambiado el nombre por Juan Marco y cohabitaba con otra mujer. Juan Roldán entregó la carta a su amo, quien escribió a la Santa Inquisición y adjuntó dicha carta como prueba. El caso finalmente se suspendió por la falta de pruebas que demuestrasen que Marco Amarita y Juan Marco eran la misma persona. Tiene una anotación de otra mano, de Joseph de Sancha y Ayala (quien entrega la carta a la Inquisición) en el margen izquierdo: "Mujer de Marcos Amarita: Leonor de Alarcon que esta en Madrid y es hermana de Fernando de Alarcon".