O seu marido, Luís Dias foi preso pela inquisição em 1538, por tentar persuadir outros cristãos-novos de que ele era um profeta e o verdadeiro Messias. Isabel Fernandes recebeu uma carta do seu marido, Luís Dias; este recebeu uma carta de um Anónimo e, de acordo com a acusação, o autor da carta tratava Luís Dias com veneração tal, que a carta parecia ser dirigida mais a pessoa divina do que humana